Su beca de urología la realizó en la Pontificia Universidad Católica de Chile (PUC) entre 1971 y 1973. En 1973 fundó el Servicio de Urología Pediátrica del Hospital Exequiel González Cortés. El Dr. Zubieta fue director académico de la Universidad de Chile en el Hospital Exequiel González Cortés, coordinador de la Comisión de Urología Pediátrica de la Universidad de Chile y profesor Titular de la misma universidad. Además, presidió la Sociedad Chilena de Cirugía Infantil, la Sociedad Iberoamericana de Urología Pediátrica y la Sociedad Chilena de Urología, entre otras. También fue jefe del Centro de Responsabilidad Quirúrgico del Hospital Exequiel González Cortés, su último cargo cuando se acogió a retiro en 2019.
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